В активных артикулах нулевые остатки

По-умолчанию плагин считает, что все артикулы, которые есть в прайсе - активные и будет использовать количество из прайса.

Если в прайсе есть артикулы, у которых указано нулевое количество (или становится таким после сопоставления соответствий из настройки "Соответствие слов и количества"), то будет записано именно то количество, которое указано.

Чтобы это исправить обратите внимание на настройку "Не выбирать поставщика, если в прайс-листе количество = 0"